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活細(xì)胞內(nèi)蛋白穩(wěn)定性實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè):基于內(nèi)含肽生物傳感器的高通量分析新范式

更新時(shí)間:2025-06-24      點(diǎn)擊次數(shù):552
  蛋白質(zhì)穩(wěn)定性是影響其功能、折疊和降解的關(guān)鍵因素,在活細(xì)胞內(nèi)直接測(cè)量蛋白穩(wěn)定性一直是實(shí)驗(yàn)研究中的難題。傳統(tǒng)方法往往操作復(fù)雜、耗時(shí)長(zhǎng),且難以在活細(xì)胞中獲得定量結(jié)果?;趦?nèi)含肽(Intein)的生物傳感器為解決這一問(wèn)題提供了新思路。
 
  內(nèi)含肽生物傳感器的原理
 
  內(nèi)含肽是一類存在于宿主蛋白中的可自剪接多肽序列,可通過(guò)自催化蛋白剪接反應(yīng)將自身切除,并將兩端外顯肽重新連接形成成熟蛋白。由于其對(duì)肽鍵的精準(zhǔn)重排能力,內(nèi)含肽已廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)工程。部分微生物中的內(nèi)含肽還可感應(yīng)金屬、熱、氧化應(yīng)激等環(huán)境刺激,作為調(diào)控蛋白功能的傳感元件。基于此,研究者開發(fā)了多種剪接依賴型報(bào)告系統(tǒng),用于篩選剪接抑制劑或構(gòu)建生物傳感器。
 
  內(nèi)含肽生物傳感器在蛋白穩(wěn)定性監(jiān)測(cè)中的應(yīng)用
 
  2025年,美國(guó)莫瑞州立大學(xué)Christopher W. Lennon團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種基于內(nèi)含肽的生物傳感器,用于活細(xì)胞內(nèi)蛋白穩(wěn)定性的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。該方法的核心是將目標(biāo)蛋白插入內(nèi)含肽內(nèi)部,而非直接融合于報(bào)告蛋白,有效避免了目標(biāo)蛋白對(duì)報(bào)告蛋白結(jié)構(gòu)和功能的干擾。通過(guò)剪接恢復(fù)氨基糖苷類抗性基因(KanR)的功能,使剪接活性與細(xì)胞存活直接相關(guān),便于通過(guò)生長(zhǎng)曲線評(píng)估蛋白穩(wěn)定性。
 
  具體而言,該方法利用內(nèi)含肽在特定條件下自發(fā)剪接的特性,將目標(biāo)蛋白的穩(wěn)定性與剪接效率直接掛鉤,實(shí)現(xiàn)體內(nèi)蛋白穩(wěn)定性的定量評(píng)估。當(dāng)目標(biāo)蛋白穩(wěn)定時(shí),內(nèi)含肽剪接效率高,KanR功能恢復(fù),細(xì)胞在含抗生素的培養(yǎng)基中存活;反之,當(dāng)目標(biāo)蛋白不穩(wěn)定時(shí),內(nèi)含肽剪接效率低,KanR功能無(wú)法恢復(fù),細(xì)胞死亡。通過(guò)監(jiān)測(cè)細(xì)胞存活率,可以間接評(píng)估目標(biāo)蛋白的穩(wěn)定性。
 
  高通量分析的實(shí)現(xiàn)
 
  該方法具有高通量分析的潛力。通過(guò)將不同突變體或不同處理?xiàng)l件下的細(xì)胞分別培養(yǎng)在微孔板中,可以同時(shí)監(jiān)測(cè)多個(gè)樣本的蛋白穩(wěn)定性。此外,結(jié)合自動(dòng)化液體處理系統(tǒng)和高通量測(cè)序技術(shù),可以進(jìn)一步提高分析通量。
 
  應(yīng)用前景
 
  基于內(nèi)含肽的生物傳感器在蛋白穩(wěn)定性監(jiān)測(cè)中具有廣泛的應(yīng)用前景:
 
  快速評(píng)估突變對(duì)蛋白穩(wěn)定性的影響:通過(guò)將突變體插入內(nèi)含肽內(nèi)部,可以快速篩選出影響蛋白穩(wěn)定性的關(guān)鍵突變。
 
  藥物篩選:通過(guò)監(jiān)測(cè)藥物處理后蛋白穩(wěn)定性的變化,可以評(píng)估藥物對(duì)蛋白功能的影響,為藥物研發(fā)提供重要依據(jù)。
 
  伴侶蛋白表達(dá)優(yōu)化:通過(guò)監(jiān)測(cè)伴侶蛋白表達(dá)對(duì)目標(biāo)蛋白穩(wěn)定性的影響,可以優(yōu)化伴侶蛋白的表達(dá)條件,提高重組蛋白的生產(chǎn)效率。
 
  小分子化合物篩選:通過(guò)識(shí)別影響蛋白穩(wěn)定性或剪接反應(yīng)的小分子化合物,可以探索其作用機(jī)制,為新藥研發(fā)提供候選化合物。
 
  結(jié)論
 
  基于內(nèi)含肽的生物傳感器為活細(xì)胞內(nèi)蛋白穩(wěn)定性的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)提供了一種新范式。該方法具有操作簡(jiǎn)便、高通量、定量準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),在蛋白穩(wěn)定性研究、藥物篩選和重組蛋白生產(chǎn)等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景。隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,基于內(nèi)含肽的生物傳感器有望在生命科學(xué)研究和生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)中發(fā)揮更大的作用。
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